مقدمه: اختلال در میزان لیپیدها و آپولیپوپروتئین ها از عوامل خطرساز بیماری قلبی - عروقی محسوب می شود و خوشه ژنی APOAI-CIII-AVI نقش مهمی در تنظیم سوخت و ساز و میزان لیپیدها دارد. هدف پژوهش حاضر، بررسی ارتباط 5 پلی مورفیسم در ناحیه ژنی Apo11q با میزان لیپیدها در سرم می باشد.مواد و روش ها: مطالعه مقطعی حاضر روی 823 نفر (340 مرد و 483 زن) از جمعیت مورد مطالعه قند و لیپید تهران (TLGS) انجام گرفت که از میان 10759 نفر 19 تا 70 ساله، به روش تصادفی انتخاب شدند. متغیرهای تن سنجی و میزان غلظت Apo AIV, Apo B, Apo CIII TG, Chol, HDL, Apo و Al برای افراد مورد پژوهش اندازه گیری شد. قطعات ژنی به روش PCR، تکثیر و پلی مورفیسم ها با کمک آنزیم های محدودکننده تعیین شدند.یافته ها: فراوانی اللی پلی مورفیسم ها در جمعیت زنان و مردان، تفاوت معنی داری نداشت. توزیع ژنوتیپ ها برای تمام پلی مورفیسم ها به جز Apo Al (+83C>T) از قانون هاردی - واینبرگ تبعیت نمود. یافته های این پژوهش، بیانگر ارتباط بین پلی مورفیسم های ناحیه ژنی مورد نظر با میزان TG, HDL-C, HDL2, Apo Al و Apo B می باشد. در نتیجه تجزیه و تحلیل هاپلوتیپ ها، علاوه بر متغیرهای یاد شده، میزان کلسترول LDL- و کلسترول تام نیز با پلی مورفیسم ها، ارتباط نشان دادند.نتیجه گیری: یافته های پژوهش حاضر نشان دهنده ارتباط تغییرات ژنتیکی در خوشه ژنی Apo AI-CIII-AIV با میزان لیپیدها در سرم و تنظیم سوخت و ساز آنها در جمعیت تهرانی بود.