به منظور بررسی تنوع ژنتیکی نماتد زخم ریشه چای، Pratylenchus loosi Loof, 1960 در باغ های آلوده چای استان گیلان، تعداد 15 نمونه خاک و ریشه از مناطق مختلف استان گیلان جمع آوری گردید. نمونه های جمع آوری شده درون کیسه های پلاستیکی به آزمایشگاه نماتد شناسی منتقل و تا زمان استخراج در شرایط رطوبتی مناسب و دمای 10-5 درجه سانتیگراد نگه داری گردید. پس از استخراج نماتد از نمونه ها و شناسایی گونه، DNA نماتد هر جمعیت استخراج و نواحی ژنومی ITS-rDNA و D2/D3 LSU- rDNA با بهره گیری از آغازگرهای اختصاصی نواحی ژنومی مذکور توسط واکنش زنجیره ای آنزیم پلی مراز تکثیر شد. نواحی ژنومی تکثیر شده جمعیت های مورد مطالعه توسط واکنش زنجیره ای پلی مراز با تیمار آنزیم های اندونوکلئاز Alu I, Hin6I, Mbo I, Hind II, Hind III, PstI, DraI و Hae IIIهضم آنزیمی گردید. نتایج بدست آمده از تکثیر نواحی ژنومی ITS- rDNA و D2/D3 LSU- rDNA توسط واکنش زنجیره ای پلی مراز، قطعه ژنومی واحدی به ترتیب به اندازه 1250 و 787 جفت باز (bp) در مورد هر کدام از جمعیت های مورد مطالعه بدست داد. با هضم آنزیمی هر کدام از نواحی مذکور جمعیت های مورد مطالعه توسط آنزیم های اندونوکلئاز فوق الذکر چند شکلی در قطعات ژنومی ایجاد شده مشاهده نگردید. توالی ناحیه ژنومی D2/D3 LSU- rDNA برای آنزیم های برشی DraI, PstI و HindIII همچنین ناحیه ژنومی ITS-rDNA برای آنزیم HaeIII فاقد جایگاه برشی تشخیص داده شد.